OgygiaSpoiler masqué
Michael Scofield est présumé mort il y a sept ans. Theodore Bagwell est libéré du pénitencier d'État de Fox River dans l'Illinois ; en récupérant ses affaires personnelles, il découvre une mystérieuse enveloppe envoyée depuis le Yémen. Pendant ce temps, Lincoln Burrows se trouve poursuivi par des hommes à qui il doit de l'argent ; après les avoir semés, il découvre, à sa grande stupeur, T-Bag sur le porche de sa maison. Celui-ci lui montre alors le contenu de l'enveloppe : il s'agit d'une photo de Michael prise dans une prison, accompagnée d'une phrase manuscrite. Lincoln est dubitatif, et, après avoir congédié Theodore, se rend alors à Ithaca retrouver Sara, qui s'est remariée, et son neveu, Michael Scofield Jr. Cette dernière ne croit pas non plus à la véracité de ce document. En route, Burrows a l'impression d'être suivi par deux voitures.
T-Bag reçoit lui un e-mail mystérieux de la part d'un chirurgien prothésiste lui donnant rendez-vous. Ce dernier lui propose de lui installer une prothèse révolutionnaire pour sa main pouvant être contrôlée par son cerveau. La personne qui finance ce projet est anonyme, mais tient absolument à ce que ce soit Bagwell qui en bénéficie.
Burrows découvre par hasard, à la lumière du soleil, que certaines lettres de la phrase manuscrite sous la photo ont été écrites à l'encre alors que les autres le sont au crayon ; en gommant ces dernières, il trouve un message codé : Ogygia, qui se trouve être le nom d'une prison yéménite. Afin d'en être sûr une bonne fois pour toutes, Lincoln déterre le cercueil de son frère et découvre, avec effroi, que celui-ci ne contient que la veste de Michael et non son corps. Sur la route, il perd le contrôle de sa voiture électrique, qui est manipulée par un individu à distance afin de l'assassiner ; Linc tourne le volant in extremis, et se projette dans un lac avant de se cacher. Il appelle alors Sara, lui parlant de la tombe vide et de l'a
